此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见TENxVisiumData.
Bioconductor版本:3.13
由10X Genomics收集Visium空间基因表达数据集,格式化为SpatialExperiment类对象。数据涵盖各种生物和组织,包括:单段和多段实验,以及单段进行全转录组和靶向组分析。数据集可用于测试和作为包中的示例,用于教程和工作流演示,或类似目的。
作者:Helena L. Crowell [aut, cre]
维护者:Helena L. Crowell < Helena at Crowell .eu>
引文(从R内,输入引用(“TENxVisiumData”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("TENxVisiumData")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“TENxVisiumData”)
超文本标记语言 | R脚本 | TENxVisiumData |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,Homo_sapiens_Data,Mus_musculus_Data,ReproducibleResearch |
版本 | 1.0.2中 |
许可证 | MIT +文件许可证 |
取决于 | ExperimentHub,SpatialExperiment |
进口 | 跑龙套 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/helenalc/TENxVisiumData |
BugReports | https://github.com/helenalc/TENxVisiumData/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | TENxVisiumData_1.0.2.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TENxVisiumData |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TENxVisiumData |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TENxVisiumData/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |