TENxVisiumData

DOI:10.18129 / B9.bioc.TENxVisiumData

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见TENxVisiumData

由10X Genomics提供的Visium空间基因表达数据

Bioconductor版本:3.13

由10X Genomics收集Visium空间基因表达数据集,格式化为SpatialExperiment类对象。数据涵盖各种生物和组织,包括:单段和多段实验,以及单段进行全转录组和靶向组分析。数据集可用于测试和作为包中的示例,用于教程和工作流演示,或类似目的。

作者:Helena L. Crowell [aut, cre]

维护者:Helena L. Crowell < Helena at Crowell .eu>

引文(从R内,输入引用(“TENxVisiumData”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("TENxVisiumData")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“TENxVisiumData”)

超文本标记语言 R脚本 TENxVisiumData
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews ExperimentDataExperimentHubExpressionDataHomo_sapiens_DataMus_musculus_DataReproducibleResearch
版本 1.0.2中
许可证 MIT +文件许可证
取决于 ExperimentHubSpatialExperiment
进口 跑龙套
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/helenalc/TENxVisiumData
BugReports https://github.com/helenalc/TENxVisiumData/issues
全靠我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 TENxVisiumData_1.0.2.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TENxVisiumData
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TENxVisiumData
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/TENxVisiumData/
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