这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14。
Bioconductor版本:3.13
包包含8 BAM文件,1 /测序运行。每个BAM文件是通过(1)调整读取(paired-end)与TopHat2完整hg19基因组,然后(2)构造子集只保留chr14比对。看到加入数字e - mtab - 1147 ArrayExpress数据库中有关实验的细节,包括链接到发表的研究(Zarnack et al ., 2012)和FASTQ文件。
作者:Herve页面
维护人员:< hpages.on Herve页面。github在gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
参考手册 |
biocViews | ArrayExpress,ExperimentData,地理,基因组,Homo_sapiens_Data,NCI,RNASeqData,SequencingData |
版本 | 0.30.0 |
许可证 | LGPL |
取决于 | |
进口 | |
链接 | |
建议 | GenomicAlignments,BiocManager |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MTAB-1147/ |
取决于我 | samExploreR,测序 |
进口我 | |
建议我 | BiocParallel,GenomicAlignments,GenomicFiles,GenomicRanges,咆哮,Rsamtools,SplicingGraphs |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14_0.30.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13(高山脉) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14 |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14/ |
包下载报告 | 下载数据 |