此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见PasillaTranscriptExpr.
Bioconductor版本:3.13
提供来自Brooks等人的RNA-Seq数据的kallisto工作流和转录本表达。
作者:Malgorzata Nowicka [aut, cre]
维护者:Malgorzata Nowicka
引文(从R内,输入引用(“PasillaTranscriptExpr”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("PasillaTranscriptExpr")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“PasillaTranscriptExpr”)
R脚本 | 使用kallisto从pasilla数据集中生成转录本计数 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | Drosophila_melanogaster_Data,ExperimentData,ExpressionData,地理,基因组,RNASeqData,SequencingData |
版本 | 1.20.0 |
许可证 | GPL (>= 3) |
取决于 | R (>= 3.3.0) |
进口 | |
链接 | |
建议 | rtracklayer,BiocStyle,knitr,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | DRIMSeq |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | PasillaTranscriptExpr_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PasillaTranscriptExpr |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/PasillaTranscriptExpr |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/PasillaTranscriptExpr/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |