IHWpaper

DOI:10.18129 / B9.bioc.IHWpaper

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅IHWpaper

再现人物IHW纸

Bioconductor版本:3.13

这个包方便包装所有功能需要复制的数据IHW纸(https://www.nature.com/articles/nmeth.3885)和最新arXiv预印本可用在http://arxiv.org/abs/1701.05179。因此它是一个同伴包Bioconductor IHW包。

作者:Nikos Ignatiadis (aut (cre)

维修工:Nikos Ignatiadis < Nikos。在gmail.com ignatiadis01 >

从内部引用(R,回车引用(“IHWpaper”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“IHWpaper”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“IHWpaper”)

HTML R脚本 NMeth纸:解释热带病研究和培训特别规划
HTML R脚本 NMeth纸:IHW-Bonferroni模拟
HTML R脚本 NMeth纸:真实数据的例子
HTML R脚本 NMeth纸:模拟数据
HTML R脚本 NMeth纸:分层柱状图
HTML R脚本 统计数据:与IHW-Benjamini-Yekutieli hQTL分析
HTML R脚本 不同:BH解释/可视化
HTML R脚本 不同:Grenander估计应用于IHW (vs ECDF)
HTML R脚本 各种真实数据的例子:1-fold权函数
HTML R脚本 不同:tdr和pvalue排斥地区
HTML R脚本 不同:重量和独立的过滤
PDF 参考手册

细节

biocViews ExperimentData,ExpressionData,RNASeqData,ReproducibleResearch
版本 1.20.0
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 3.3),IHW
进口 Rcpp、统计数据、样条函数方法,跑龙套,DESeq2,SummarizedExperiment,fdrtool,genefilter,qvalue,Biobase,BiocGenerics,BiocParallel,dplyr、网格ggplot2,cowplot
链接 Rcpp
建议 testthat,RColorBrewer,wesanderson,尺度,gridExtra,BiocStyle,knitr,rmarkdown,气道,locfdr,tidyr,ggbio,latex2exp
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 IHWpaper_1.20.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/IHWpaper
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ IHWpaper
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/IHWpaper/
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