这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅IHWpaper。
Bioconductor版本:3.13
这个包方便包装所有功能需要复制的数据IHW纸(https://www.nature.com/articles/nmeth.3885)和最新arXiv预印本可用在http://arxiv.org/abs/1701.05179。因此它是一个同伴包Bioconductor IHW包。
作者:Nikos Ignatiadis (aut (cre)
维修工:Nikos Ignatiadis < Nikos。在gmail.com ignatiadis01 >
从内部引用(R,回车引用(“IHWpaper”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“IHWpaper”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“IHWpaper”)
HTML | R脚本 | NMeth纸:解释热带病研究和培训特别规划 |
HTML | R脚本 | NMeth纸:IHW-Bonferroni模拟 |
HTML | R脚本 | NMeth纸:真实数据的例子 |
HTML | R脚本 | NMeth纸:模拟数据 |
HTML | R脚本 | NMeth纸:分层柱状图 |
HTML | R脚本 | 统计数据:与IHW-Benjamini-Yekutieli hQTL分析 |
HTML | R脚本 | 不同:BH解释/可视化 |
HTML | R脚本 | 不同:Grenander估计应用于IHW (vs ECDF) |
HTML | R脚本 | 各种真实数据的例子:1-fold权函数 |
HTML | R脚本 | 不同:tdr和pvalue排斥地区 |
HTML | R脚本 | 不同:重量和独立的过滤 |
参考手册 |
biocViews | ExperimentData,ExpressionData,RNASeqData,ReproducibleResearch |
版本 | 1.20.0 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 3.3),IHW |
进口 | Rcpp、统计数据、样条函数方法,跑龙套,DESeq2,SummarizedExperiment,fdrtool,genefilter,qvalue,Biobase,BiocGenerics,BiocParallel,dplyr、网格ggplot2,cowplot |
链接 | Rcpp |
建议 | testthat,RColorBrewer,wesanderson,尺度,gridExtra,BiocStyle,knitr,rmarkdown,气道,locfdr,tidyr,ggbio,latex2exp |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | IHWpaper_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13(高山脉) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/IHWpaper |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ IHWpaper |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/IHWpaper/ |
包下载报告 | 下载数据 |