HighlyReplicatedRNASeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.HighlyReplicatedRNASeq

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见HighlyReplicatedRNASeq

收集大量重复RNA-Seq实验

Bioconductor版本:3.13

具有多次复制的批量RNA-seq数据集的基因水平计数矩阵数据。数据作为易于使用的summarizeexperiment对象提供。通过这个包可以访问的源数据来自https://github.com/bartongroup/profDGE48。

作者:Constantin Ahlmann-Eltze [aut, cre]

维护者:Constantin Ahlmann-Eltze

引文(从R内,输入引用(“HighlyReplicatedRNASeq”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("HighlyReplicatedRNASeq")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“HighlyReplicatedRNASeq”)

超文本标记语言 R脚本 探索来自Schurch等人(2016)研究的86个散装rna序列样本
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews ExperimentDataExperimentHubExpressionDataRNASeqDataSequencingData
版本 1.4.0
许可证 MIT +文件许可证
取决于 SummarizedExperimentExperimentHub
进口 S4Vectors
链接
建议 BiocStyleBiocFileCacheknitrrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/const-ae/HighlyReplicatedRNASeq
BugReports https://github.com/const-ae/HighlyReplicatedRNASeq/issues
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 HighlyReplicatedRNASeq_1.4.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HighlyReplicatedRNASeq
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HighlyReplicatedRNASeq
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/HighlyReplicatedRNASeq/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网