此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见HighlyReplicatedRNASeq.
Bioconductor版本:3.13
具有多次复制的批量RNA-seq数据集的基因水平计数矩阵数据。数据作为易于使用的summarizeexperiment对象提供。通过这个包可以访问的源数据来自https://github.com/bartongroup/profDGE48。
作者:Constantin Ahlmann-Eltze [aut, cre]
维护者:Constantin Ahlmann-Eltze
引文(从R内,输入引用(“HighlyReplicatedRNASeq”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("HighlyReplicatedRNASeq")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“HighlyReplicatedRNASeq”)
超文本标记语言 | R脚本 | 探索来自Schurch等人(2016)研究的86个散装rna序列样本 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,RNASeqData,SequencingData |
版本 | 1.4.0 |
许可证 | MIT +文件许可证 |
取决于 | SummarizedExperiment,ExperimentHub |
进口 | S4Vectors |
链接 | |
建议 | BiocStyle,BiocFileCache,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/const-ae/HighlyReplicatedRNASeq |
BugReports | https://github.com/const-ae/HighlyReplicatedRNASeq/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | HighlyReplicatedRNASeq_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HighlyReplicatedRNASeq |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HighlyReplicatedRNASeq |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/HighlyReplicatedRNASeq/ |
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