GeuvadisTranscriptExpr

DOI:10.18129 / B9.bioc.GeuvadisTranscriptExpr

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见GeuvadisTranscriptExpr．

来自GEUVADIS项目的包含转录本表达和双等位基因型的数据包

Bioconductor版本:3.13

Lappalainen等人提供了GEUVADIS项目中CEU个体19号染色体对应的转录本表达和双等位基因型。

作者:Malgorzata Nowicka [aut, cre]

维护者:Malgorzata Nowicka

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GeuvadisTranscriptExpr")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“GeuvadisTranscriptExpr”)

PDF	R脚本	GEUVADIS项目转录本表达和基因型的预处理和制备，用于sQTL分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData，ExpressionData，基因组，Homo_sapiens_Data，RNASeqData，SNPData，SequencingData
版本	1.20.0
许可证	GPL (>= 3)
取决于	R (>= 3.3.0)
进口
链接
建议	limma，rtracklayer，GenomicRanges，Rsamtools，VariantAnnotation、工具、BiocStyle，knitr，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	DRIMSeq
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	GeuvadisTranscriptExpr_1.20.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GeuvadisTranscriptExpr
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GeuvadisTranscriptExpr
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GeuvadisTranscriptExpr/
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