GenomicDistributionsData

DOI:10.18129 / B9.bioc.GenomicDistributionsData

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GenomicDistributionsData

参考数据GenomicDistributions包

Bioconductor版本:3.13

这个包提供了GenomicDistributions包可以使用参考数据。原始数据和辅助函数从ensembldb获得和处理。数据文件可用于以下基因组装配:hg19, hg38, mm9 mm10。

作者:米甲Stolarczyk (aut) Kristyna Kupkova (aut (cre),何塞Verdezoto (aut),约翰•劳森(施)杰森·史密斯(施),内森·c·谢菲尔德(施)

维护人员:Kristyna Kupkova < kristynakupkova gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“GenomicDistributionsData”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GenomicDistributionsData”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GenomicDistributionsData”)

HTML R脚本 1。开始使用GenomicDistributionsData
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews ExperimentData,ExperimentHub,基因组
版本 1.0.0
许可证 BSD_2_clause +文件许可证
取决于 R (> = 4.1)
进口 ExperimentHub(> = 1.14.0),AnnotationHub,AnnotationFilter,data.table跑龙套,BSgenome,GenomeInfoDb,GenomicFeatures,GenomicRanges,ensembldb
链接
建议 knitr,BiocStyle,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports http://github.com/databio/GenomicDistributionsData
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 GenomicDistributionsData_1.0.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GenomicDistributionsData
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GenomicDistributionsData
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GenomicDistributionsData/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网