GenomicDistributionsData

DOI:10.18129 / B9.bioc.GenomicDistributionsData

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GenomicDistributionsData。

参考数据GenomicDistributions包

Bioconductor版本:3.13

这个包提供了GenomicDistributions包可以使用参考数据。原始数据和辅助函数从ensembldb获得和处理。数据文件可用于以下基因组装配:hg19, hg38, mm9 mm10。

作者:米甲Stolarczyk (aut) Kristyna Kupkova (aut (cre),何塞Verdezoto (aut),约翰•劳森(施)杰森·史密斯(施),内森·c·谢菲尔德(施)

维护人员:Kristyna Kupkova < kristynakupkova gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GenomicDistributionsData”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GenomicDistributionsData”)

HTML	R脚本	1。开始使用GenomicDistributionsData
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ExperimentData,ExperimentHub,基因组
版本	1.0.0
许可证	BSD_2_clause +文件许可证
取决于	R (> = 4.1)
进口	ExperimentHub(> = 1.14.0),AnnotationHub,AnnotationFilter,data.table跑龙套,BSgenome,GenomeInfoDb,GenomicFeatures,GenomicRanges,ensembldb
链接
建议	knitr,BiocStyle,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	http://github.com/databio/GenomicDistributionsData
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GenomicDistributionsData_1.0.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GenomicDistributionsData
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GenomicDistributionsData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GenomicDistributionsData/
包下载报告	下载数据