DuoClustering2018

DOI:10.18129 / B9.bioc.DuoClustering2018

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见DuoClustering2018

数据、聚类结果和可视化函数来自Duò等(2018)

Bioconductor版本:3.13

预处理实验和模拟scRNA-seq数据集,用于评估Duò等人(2018)中scRNA-seq数据的聚类方法。还包含对每个数据集应用几种聚类方法的结果,以及用于绘制方法性能的函数。

作者:Angelo Duò, Charlotte Soneson

维护者:Angelo Duò < Angelo。在icloud.com>

引文(从R内,输入引用(“DuoClustering2018”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("DuoClustering2018")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“DuoClustering2018”)

超文本标记语言 R脚本 应用聚类方法
超文本标记语言 R脚本 剧情表现总结
超文本标记语言 R脚本 使用iSEE可视化数据集和聚类结果
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ExperimentDataSingleCellData
版本 1.10.0
许可证 GPL (> = 2)
取决于
进口 ExperimentHub跑龙套,magrittrdplyrtidyrmclustggplot2purrrreshape2冬青ggthemes、统计数据、方法
链接
建议 knitrrmarkdownBiocStyleiSEESingleCellExperimentSummarizedExperimentplyr
SystemRequirements
增强了
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 DuoClustering2018_1.10.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DuoClustering2018
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DuoClustering2018
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/DuoClustering2018/
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