此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见DuoClustering2018.
Bioconductor版本:3.13
预处理实验和模拟scRNA-seq数据集,用于评估Duò等人(2018)中scRNA-seq数据的聚类方法。还包含对每个数据集应用几种聚类方法的结果,以及用于绘制方法性能的函数。
作者:Angelo Duò, Charlotte Soneson
维护者:Angelo Duò < Angelo。在icloud.com>
引文(从R内,输入引用(“DuoClustering2018”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("DuoClustering2018")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“DuoClustering2018”)
超文本标记语言 | R脚本 | 应用聚类方法 |
超文本标记语言 | R脚本 | 剧情表现总结 |
超文本标记语言 | R脚本 | 使用iSEE可视化数据集和聚类结果 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ExperimentData,SingleCellData |
版本 | 1.10.0 |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | |
进口 | ExperimentHub跑龙套,magrittr,dplyr,tidyr,mclust,ggplot2,purrr,reshape2,冬青,ggthemes、统计数据、方法 |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle,iSEE,嘘,SingleCellExperiment,SummarizedExperiment,plyr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | 科拉尔,用水晶球占卜 |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | DuoClustering2018_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DuoClustering2018 |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DuoClustering2018 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/DuoClustering2018/ |
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