此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见phastCons100way.UCSC.hg19.
Bioconductor版本:3.13
存储UCSC phastCons对人类基因组(hg19)的保护分数,从与其他99种脊椎动物的多次比对中计算。
作者:Robert Castelo [aut, cre]
维护者:Robert Castelo < Robert。Castelo在upf.edu>
引文(从R内,输入引用(“phastCons100way.UCSC.hg19”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" phastcon100way . ucsc .hg19")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | AnnotationData,遗传学,GenomicScores,Homo_sapiens |
版本 | 3.7.2章 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.0.0),GenomicScores(> = 1.3.19) |
进口 | 跑龙套,S4Vectors,IRanges,GenomicRanges,GenomeInfoDb,BSgenome |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | RareVariantVis |
建议我 | ATACseqQC,GenomicScores,VariantFiltering |
链接到我 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | phastCons100way.UCSC.hg19_3.7.2.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/phastCons100way.UCSC.hg19/ |
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