hpAnnot

DOI:10.18129 / B9.bioc.hpAnnot

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见hpAnnot．

注释包Hipathia包

Bioconductor版本:3.13

包含Hipathia包的示例和注释数据的包。Hipathia是一种从转录组数据计算沿信号通路的信号转导的方法。该方法基于一种迭代算法，该算法能够通过考虑每个基因的表达水平和到达网络的信号强度来计算通过网络节点的信号强度。它还提供了一种新的函数分析方法，允许计算到达每个路径注释的函数的信号。Hipathia依赖于这个包来发挥作用。

作者:Marta R. Hidalgo [aut, cre]， José Carbonell-Caballero [ctb]， Francisco Salavert [ctb]， Alicia Amadoz [ctb]， Çankut Cubuk [ctb]， Joaquin Dopazo [ctb]

维护者:Marta R. Hidalgo < Marta。伊达尔戈在展望>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("hpAnnot")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“hpAnnot”)

PDF	R脚本	hpAnnot
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AnnotationData，CustomDBSchema，FunctionalAnnotation，PackageType
版本	1.0.1
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.5)
进口
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	hpAnnot_1.0.1.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/hpAnnot/
软件包下载报告	下载数据