XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38

DOI:10.18129 / B9.bioc.XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38。

额外的SNP地点智人(dbSNP构建141)

Bioconductor版本:3.13

额外的SNP等位基因位置和智人从NCBI dbSNP构建141。源数据文件用于这个包是由NCBI 5月1日,2014年,包含snp GRCh38映射到参考基因组。而SNPlocs.Hsapiens.dbSNP141。GRCh38包只包含分子变化类“国民党”,这个包包含其他类的分子变化(named-locus (del、杂合的微卫星,缺乏变化,混合,和multinucleotide-polymorphism)。

作者:Herve页面

维修工:h .页< hpages fhcrc.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData,遗传学,Homo_sapiens,XtraSNPlocs
版本	0.99.12
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.10),S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,BSgenome(> = 1.35.5)
进口	方法,跑龙套,S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,BSgenome
链接
建议	SNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38,BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38(> = 1.3.19)
SystemRequirements
增强了
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进口我
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我的链接

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38_0.99.12.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38/
包下载报告	下载数据