BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19

智人全基因组序列(UCSC版本hg19,基于GRCh37.p13)

Bioconductor版本:3.13

由UCSC提供的智人(人类)的完整基因组序列(hg19,基于GRCh37.p13)并存储在Biostrings对象中。

作者:Bioconductor开发团队

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

引文(从R内,输入引用(“BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" bsgenome . hspiens . ucsc .hg19")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

PDF 参考手册

细节

biocViews AnnotationDataBSgenome遗传学Homo_sapiens
版本 3
许可证 艺术- 2.0
取决于 BSgenome(> = 1.54.0)
进口 BSgenome
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 注释BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked食典委范围测序tra利用变体
进口我 appreci8RbrainflowprobesBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.maskedChIPCompcircRNAprofilerdecompTumor2Sig希尔达MADSEQmusicatkRareVariantVis美国广播公司TCGAWorkflowtrenauncoverappLibYAPSA
建议我 AneuFinderATACseqQCBadRegionFinderBasic4CseqBBCAnalyzerbiovizBaseChIPpeakAnnochromVARcnCNVfilteRCRISPRseekcustomProDBDAMEfinderDNAshapeResATACFDb.FANTOM4.promoters.hg19FDb.UCSC.snp135common.hg19FDb.UCSC.snp137common.hg19gcapcGenomicAlignmentsGenomicFeaturesGenomicRangesGenomicScoresGenVisRggbiogmapRGUIDEseqGvizh5vcHiCDCPlusInPAS感兴趣IsoformSwitchAnalyzeRkaryoploteRmaftoolsMEDIPSMesKitMinimumDistance海市蜃楼motifbreakRmotifmatchrMutationalPatternsORFikOrganismDbi网页排名plyrangesqseaR453Plus1ToolboxREMPrGADEMRiboProfilingRsamtoolsRSVSimrtracklayerSGSeq签名者SigsPackSNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20120608SNPlocs.Hsapiens.dbSNP142.GRCh37SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37StructuralVariantAnnotationsupersigsUMI4CatsVariantAnnotationwavClusteRXtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37
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源包 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19_1.4.3.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19/
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