AHPathbankDbs

DOI:10.18129 / B9.bioc.AHPathbankDbs

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见AHPathbankDbs．

与PathBank通路相关的代谢物和蛋白质(用于AnnotationHub)

Bioconductor版本:3.13

该软件包提供了与PathBank通路相关的代谢物和蛋白质的全面映射表。该表包括HMDB, KEGG, ChEBI, CAS, Drugbank, Uniprot id。表中列出了10个物种(“智人”、“大肠杆菌”、“小家鼠”、“拟南芥”、“酿酒酵母”、“金牛”、“秀丽隐线虫”、“褐家鼠”、“黑腹果蝇”和“铜绿假单胞菌”)。这些表信息可用于代谢物集(和其他)富集分析。

作者:Kozo Nishida [aut, cre]

维护者:Kozo Nishida < Kozo。在gmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“AHPathbankDbs”)

超文本标记语言	R脚本	为AnnotationHub提供PathbankDb数据库
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AnnotationData，AnnotationHub，CustomDBSchema，FunctionalAnnotation
版本	0.99.5
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.1.0)
进口	AnnotationHub(> = 2.23.0)
链接
建议	BiocStyle，magrittr，dplyr，宠物猫，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/kozo2/AHPathbankDbs
全靠我
进口我
建议我
链接到我

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	AHPathbankDbs_0.99.5.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/AHPathbankDbs/
软件包下载报告	下载数据