这次1.2.1版本变化,修复一个缺陷在构造子集computeLimmaDiffExpr ToxicoSet并不子集protocolData SummarizedExperiment,导致强迫一个ExpressionSet函数失败——目前只是删除protocolData SummarizedExperiment的元数据,但最终将需要固定上游ORCESTRA变化版本1.2.0——春天Bioconductor释放!1.1.0版本的变化——继续功能抽象为CoreGx -添加额外的绘图功能,如分组箱线图扩展单元测试的覆盖率> 90%,实现更快的版本的drugPertubationSignature -添加额外的绘图功能包括微分表达式分析脚本和GSEA toxico-genomic数据(limma)的变化版本1.0.0 -包存档在凹口包提交Biocondcutor——修改包依赖CoreGx更新——所有molecularProfiles现在SummarizedExperiment代替ExpressionSet——抽象一些附加功能CoreGx 0.1.2版本的变化,更新downloadTSet函数使用发表Zenodo必须检索数据,修改rankGeneDrugsPerturbation修复坏的单位转换将返回错误的浓度单位变化版本0.1.1 - Bug修复:再生TGGATESsmall(样本数据集)来修复使装饰图案的结果与以前的版本一致。版本变化0.1.0——改写情节利用ggplot2改善美学——也可以扩展绘图函数使用标准ggplot2语法-改进方案文档版本0.0.1的变化最小的方案提交