描述- - - - - - - - - - - -第一个GenoGAM包是第一步引入广义可加模型(GAM)生物领域。周围的实现主要是做优秀mgcv包,它提供了一种非常灵活的GAM框架。运行时增加的不过是要付出代价的灵活性和更大的开销。与新版本的GenoGAM mgcv取代了GAM专门为生物优化的应用程序的框架,大大descreasing运行时和开销。版本2.0中的新特性- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o的简化底层基础设施由于更换mgcv包GenoGAM的核心由一个内部的构建GAM模型biolocial应用程序的优化。这会显著减少开销,因此运行时和内存消耗。o GenoGAMDataSet现在可以有效地从SummarizedExperiment创建对象o访问GenoGAMSettings类,为计算模型的修改全局设置o包括登录不同层次更容易维护和调试包括阿秒处罚(一阶)地区覆盖率很低。包括广泛的单元测试所有功能o HDF5后台等大型数据集从1.0版人类基因组功能缺失- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -这些功能目前失踪但是在下一个版本将包含在质量检查情节o估计峰的峰宽o过滤o ggplot2策划呼吁GenoGAM适合对象o结和印第安纳州发展系数模型的特性- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -目前正在实施这些功能(与上面的)o更多的分布(特别是quasi-binomial和高斯)o更好质量检查情节o日志文件和并行环境o策划作为Gviz对象