这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅zellkonverter。
Bioconductor版本:3.13
提供的方法在Python AnnData对象和SingleCellExperiment对象之间进行转换。这些是主要用于下游Bioconductor包包装使用Python单细胞数据分析的方法。它还包括函数来读取和写入H5AD文件用于AnnData对象保存到磁盘。
作者:路加福音Zappia (aut (cre)亚伦Lun (aut)
在lazappi.id.au维护者:卢克Zappia <路加福音>
从内部引用(R,回车引用(“zellkonverter”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“zellkonverter”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“zellkonverter”)
HTML | R脚本 | /从AnnData SingleCellExperiments转换 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | DataImport,DataRepresentation,SingleCell,软件 |
版本 | 1.2.1 " |
Bioconductor自 | BioC 3.12 (r - 4.0)(1年) |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
取决于 | |
进口 | 矩阵,蛇怪,网状,SingleCellExperiment(> = 1.11.6),SummarizedExperiment,DelayedArray、方法、S4Vectors,跑龙套 |
链接 | |
建议 | covr,拼写,testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle,scRNAseq,HDF5Array,rhdf5,BiocFileCache |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/theislab/zellkonverter |
BugReports | https://github.com/theislab/zellkonverter/issues |
取决于我 | OSCA.intro |
进口我 | 伶盗龙 |
建议我 | HDF5Array |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | zellkonverter_1.2.1.tar.gz |
Windows二进制 | zellkonverter_1.2.1.zip |
macOS 10.13(高山脉) | zellkonverter_1.2.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/zellkonverter |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ zellkonverter |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/zellkonverter/ |
包下载报告 | 下载数据 |