vidger

DOI:10.18129 / B9.bioc.vidger

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅vidger。

创建快速的可视化RNAseq R中的数据

Bioconductor版本:3.13

vidger的目的是快速生成信息丰富的可视化解释结果从三个基因差异表达的广泛使用的工具:Cuffdiff DESeq2,磨边机。

作者:布兰登Monier (aut (cre),亚当McDermaid (aut),赵京(aut),秦马(aut(曾经)

维护人员:布兰登Monier <布兰登。在gmail.com monier >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“vidger”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“vidger”)

HTML	R脚本	可视化与ViDGER RNA-seq数据
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,ImmunoOncology,RNASeq,软件,可视化
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(3.5年)
许可证	GPL-3 |文件许可证
取决于	R (> = 3.5)
进口	Biobase,DESeq2,刨边机,GGally,ggplot2,ggrepel,knitr,RColorBrewer,rmarkdown,尺度统计数据,SummarizedExperiment,tidyr,跑龙套
链接
建议	BiocStyle,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/btmonier/vidger//www.anjoumacpherson.com/packages/release/bioc/html/vidger.html
BugReports	https://github.com/btmonier/vidger/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	vidger_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	vidger_1.12.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	vidger_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/vidger
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ vidger
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/vidger/
包下载报告	下载数据