tracktables

DOI:10.18129 / B9.bioc.tracktables

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅tracktables

构建IGV追踪和HTML报告

Bioconductor版本:3.13

方法来创建复杂的IGV基因组浏览器会话和动态IGV报告的HTML页面。

作者:汤姆·卡罗尔Sanjay Khadayate安妮Pajon,紫薇梁

维护人员:汤姆卡罗尔< tc.infomatics gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“tracktables”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“tracktables”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“tracktables”)

PDF R脚本 创建与tracktables IGV HTML报告
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ReportWriting,测序,软件
版本 1.26.0
Bioconductor自 BioC 3.0 (r - 3.1)(7年)
许可证 GPL (> = 3)
取决于 R (> = 3.0.0)
进口 IRanges,GenomicRanges,XVector,Rsamtools,XML,tractor.base,stringr,RColorBrewer、方法
链接
建议 knitr,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 tracktables_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 tracktables_1.26.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉) tracktables_1.26.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tracktables
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ tracktables
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/tracktables/
包下载报告 下载数据

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Bioconductor

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网