timeOmics

DOI:10.18129 / B9.bioc.timeOmics

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见timeOmics．

时间课程多组学数据集成

Bioconductor版本:3.13

timeOmics是一个通用的数据驱动框架，用于整合在同一生物样本上测量的多组纵向数据，并选择同一样本组内具有强关联的关键时间特征。时间组学的主要步骤是:1。平台和特定时间的归一化和过滤步骤;2.将每种生物建模为一个时间表达剖面;3.具有相同表达谱随时间变化的聚类特征;4.事后验证步骤。

作者:Antoine Bodein [aut, cre]， Olivier Chapleur [aut]， Kim-Anh Le Cao [aut]， Arnaud Droit [aut]

维护者:Antoine Bodein < Antoine . Bodein。1在ulval .ca>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("timeOmics")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

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browseVignettes(“timeOmics”)

超文本标记语言	R脚本	timeOmics
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	分类，聚类，DimensionReduction，FeatureExtraction，GenePrediction，ImmunoOncology，代谢组学，宏基因组，微阵列，MultipleComparison，蛋白质组学，回归，测序，软件，TimeCourse
版本	1.4.0
在Bioconductor	BioC 3.11 (R-4.0)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	mixOmics， r (>= 4.0)
进口	dplyr，tidyr，宠物猫，purrr，magrittr，ggplot2，stringr，ggrepel，propr，航空航天，plyr
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat，雪，tidyverse，igraph，gplots
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/abodein/timeOmics/issues
全靠我
进口我
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包档案

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源包	timeOmics_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	timeOmics_1.4.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	timeOmics_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/timeOmics
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/timeOmics
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/timeOmics/
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