tidySingleCellExperiment

DOI:10.18129 / B9.bioc.tidySingleCellExperiment

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅tidySingleCellExperiment。

带来SingleCellExperiment Tidyverse

Bioconductor版本:3.13

tidySingleCellExperiment是一个抽象的适配器的SingleCellExperiment容器形式的宠物猫,并允许数据操纵,策划和嵌套使用“tidyverse”

作者:斯特凡诺Mangiola (aut (cre)

维护人员:斯特凡诺Mangiola < mangiolastefano gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“tidySingleCellExperiment”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“tidySingleCellExperiment”)

HTML	R脚本	tidySingleCellExperiment包的概述
PDF		参考手册

细节

biocViews	AssayDomain,聚类,DifferentialExpression,GeneExpression,基础设施,归一化,质量控制,RNASeq,测序,软件
版本	1.2.1 "
Bioconductor自	BioC 3.12 (r - 4.0)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.0.0),SingleCellExperiment
进口	SummarizedExperiment,dplyr,宠物猫,tidyr,ggplot2,情节,magrittr,rlang,purrr,生命周期、方法、跑龙套S4Vectors,tidyselect,省略,支柱,stringr,cli,fansi
链接
建议	BiocStyle,testthat,knitr,减价,SingleCellSignalR,单,嘘,食物,tidyHeatmap,igraph,GGally,矩阵,uwot,celldex,dittoSeq,EnsDb.Hsapiens.v86
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/stemangiola/tidySingleCellExperiment
BugReports	https://github.com/stemangiola/tidySingleCellExperiment/issues
取决于我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	tidySingleCellExperiment_1.2.1.tar.gz
Windows二进制	tidySingleCellExperiment_1.2.1.zip
macOS 10.13(高山脉)	tidySingleCellExperiment_1.2.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tidySingleCellExperiment
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ tidySingleCellExperiment
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/tidySingleCellExperiment/
包下载报告	下载数据