spicyR

DOI:10.18129 / B9.bioc.spicyR

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅spicyR

原位血细胞计数数据的空间分析

Bioconductor版本:3.13

spicyR提供了一系列功能,以帮助您免疫荧光和血细胞计数成像质量数据的分析以及其他化验,可以深深表型个体细胞及其空间位置。

作者:尼古拉斯单丝绢丝(aut),埃利斯帕特里克(aut (cre)

维护人员:艾利斯帕特里克<埃利斯。帕特里克在sydney.edu.au >

从内部引用(R,回车引用(“spicyR”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“spicyR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“spicyR”)

HTML R脚本 介绍SegmentedCells
HTML R脚本 介绍了辣
PDF 参考手册

细节

biocViews CellBasedAssays,SingleCell,软件
版本 1.4.0
Bioconductor自 BioC 3.11 (r - 4.0)(1.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (> = 4.0.0)
进口 ggplot2,concaveman,BiocParallel,spatstat.core,spatstat.geom,