snapCGH

DOI:10.18129 / B9.bioc.snapCGH

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见snapCGH

aCGH数据的分割、归一化和处理

Bioconductor版本:3.13

aCGH数据的分割、规范化和处理方法;包括用于可视化单个和多个数组的原始和分段数据的绘图函数。

作者:迈克·l·史密斯,约翰·c·马里奥尼,史蒂文·麦金尼,托马斯·哈德卡斯尔,娜塔莉·p·索恩

维护者:John Marioni < Marioni at ebi.ac.uk>

引文(从R内,输入引用(“snapCGH”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“snapCGH”)

PDF R脚本 分割概述
PDF 参考手册

细节

biocViews CopyNumberVariation微阵列预处理软件TwoChannel
版本 1.62.0
在Bioconductor BioC 1.8 (R-2.3)(15.5年)
许可证 GPL
取决于 R (>= 3.5.0)
进口 aCGH集群DNAcopy很高兴,图形,grDevices,limma,方法,统计,tilingArray,跑龙套
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我 ADaCGH2
建议我 beadarraySNP
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 snapCGH_1.62.0.tar.gz
Windows二进制 snapCGH_1.62.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) snapCGH_1.62.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/snapCGH
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/snapCGH
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/snapCGH/
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