selectKSigs

DOI:10.18129 / B9.bioc.selectKSigs

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅selectKSigs。

选择的数量使用perplexity-based测量和交叉验证突变特征

Bioconductor版本:3.13

一揽子建议的突变特征的集合使用计算得分旨在困惑的体细胞突变。

作者:杨(aut (cre),祐一受伤(施)

维护人员:杨之< zyang895 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“selectKSigs”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“selectKSigs”)

HTML	R脚本	介绍希尔达
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细节

biocViews	聚类,测序,软件,SomaticMutation,StatisticalMethod
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.6)
进口	希尔达,magrittr,gtools、方法、Rcpp
链接	Rcpp
建议	knitr,rmarkdown,testthat,BiocStyle,ggplot2,dplyr,tidyr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/USCbiostats/selectKSigs
BugReports	https://github.com/USCbiostats/HiLDA/selectKSigs
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	selectKSigs_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	selectKSigs_1.4.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	selectKSigs_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/selectKSigs
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ selectKSigs
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/selectKSigs/
包下载报告	下载数据