司康饼

DOI:10.18129 / B9.bioc.scone

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见司康饼．

规范化表达式数据的单单元概述

Bioconductor版本:3.13

SCONE是一个R包，用于比较和排名单细胞RNA-seq和其他高通量分析的不同归一化方案的性能。

作者:Michael Cole [aut, cph]， Davide Risso [aut, cre, cph]， Matteo Borella [ctb]， Chiara Romualdi [ctb]

维护者:Davide Risso < Risso。Davide在gmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("scone")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“烤饼”)

超文本标记语言	R脚本	SCONE简介
超文本标记语言	R脚本	PsiNorm正常化
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	报道，GeneExpression，ImmunoOncology，归一化，预处理，质量控制，RNASeq，测序，SingleCell，软件，转录组
版本	1.16.1
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(4.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 3.4)，方法，SummarizedExperiment
进口	图形，统计，效用，aroma.light，BiocParallel，类，集群，作文，diptest，刨边机，fpc，gplotsgrDevices,hexbin，limma，matrixStats，mixtools，RColorBrewer，引导，rhdf5，RUVSeq，rARPACK，MatrixGenerics，SingleCellExperiment
链接
建议	BiocStyle，DT，ggplot2，knitr，miniUI，NMF，情节，reshape2，rmarkdown，食物，scRNAseq，闪亮的，testthat，visNetwork，doParallel，BatchJobs，飞溅，嘘，kableExtra，mclust，TENxPBMCData
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/YosefLab/scone/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	scone_1.16.1.tar.gz
Windows二进制	scone_1.16.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	scone_1.16.1.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scone
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/scone
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/scone/
软件包下载报告	下载数据