scds

DOI:10.18129 / B9.bioc.scds

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅scds。

In-Silico注释为单个细胞RNA序列数据的对比

Bioconductor版本:3.13

在单个细胞RNA序列(scRNA-seq)数据的组合细胞有时被认为是一个细胞(对比)。scds包中提供了注解的方法对比scRNA-seq数据计算。

作者:丹尼斯Kostka (aut (cre),姨Abha (aut)

维护人员:丹尼斯Kostka < Kostka pitt.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(scds)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (scds)

HTML	R脚本	介绍scds包
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	分类,GeneExpression,预处理,质量控制,RNASeq,测序,SingleCell,软件,转录组
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(2.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.6.0)
进口	矩阵,S4Vectors,SingleCellExperiment,SummarizedExperiment,xgboost、方法、统计数据dplyr,pROC
链接
建议	BiocStyle,knitr,rsvd,Rtsne,嘘,cowplot
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	singleCellTK
建议我	ExperimentSubset,muscData
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	scds_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	scds_1.8.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	scds_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scds
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ scds
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/scds/
包下载报告	下载数据