这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅scRecover。
Bioconductor版本:3.13
scRecover是归责的R包的单细胞RNA-seq (scRNA-seq)数据。它将检测和转嫁辍学值scRNA-seq原始读计数矩阵同时保持真正的零不变,因为都是辍学0和真正的零scRNA-seq数据。通过结合scImpute,储蓄者和魔法,scRecover不仅检测辍学和真正的零更高的精度,而且提高下游集群和可视化的结果。
作者:逸苗,Xuegong张< zhangxg tsinghua.edu.cn >
维护人员:逸苗族< miaoz13 tsinghua.org.cn >
从内部引用(R,回车引用(“scRecover”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“scRecover”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“scRecover”)
HTML | R脚本 | scRecover |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneExpression,预处理,RNASeq,测序,SingleCell,软件,转录组 |
版本 | 1.8.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.9 (r - 3.6)(2.5年) |
许可证 | GPL |
取决于 | R (> = 3.4.0) |
进口 | 统计数据、跑龙套、方法、图形doParallel,foreach平行,处罚,kernlab,rsvd,矩阵-14年(> = 1.2),质量-45年(> = 7.3),pscl(> = 1.4.9),bbmle(> = 1.0.18),gamlss(4.4 > = 0),preseqR(> = 4.0.0),储蓄者(> = 1.1.1),Rmagic(1.3.0 > =版本),BiocParallel(> = 1.12.0) |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,SingleCellExperiment,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://miaozhun.github.io/scRecover |
BugReports | https://github.com/miaozhun/scRecover/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | scRecover_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | scRecover_1.8.0.zip |
macOS 10.13(高山脉) | scRecover_1.8.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scRecover |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ scRecover |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/scRecover/ |
包下载报告 | 下载数据 |