安全
DOI:10.18129 / B9.bioc.safe
这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅安全。
意义的分析功能和表达
Bioconductor版本:3.13
安全是一个resampling-based方法检测基因表达的功能分类实验。安全可以应用于2-sample和多层次的比较,或简单线性回归。其他实验设计也可以适应通过用户定义的函数。
作者:威廉·t·巴里
维护人员:路德维希Geistlinger < ludwig_geistlinger hms.harvard.edu >
从内部引用(R,回车引用(“安全”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“安全”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“安全”)
| R脚本 | 安全手册 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | DifferentialExpression,GeneSetEnrichment,通路,软件,StatisticalMethod |
| 版本 | 3.32.0 |
| Bioconductor自 | BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 16.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R(> =测试盒框),AnnotationDbi,Biobase、方法、SparseM |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | GO.db,PFAM.db,reactome.db,hgu133a.db,breastCancerUPP,生存,foreach,doRNG,Rgraphviz,GOstats |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | PCGSE |
| 进口我 | EGSEA,EnrichmentBrowser |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | safe_3.32.0.tar.gz |
| Windows二进制 | safe_3.32.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | safe_3.32.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/safe |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/安全 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/safe/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
