rfaRm

DOI:10.18129 / B9.bioc.rfaRm

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见rfaRm．

Rfam数据库的R接口

Bioconductor版本:3.13

rfaRm为RNA家族的Rfam数据库提供了一个客户端接口。可检索的数据包括RNA家族、二级结构图像、协方差模型、每个家族中的序列、导致家族识别的比对和点括号格式的二级结构。

作者:Lara Selles Vidal, Rafael Ayala, Guy-Bart Stan, Rodrigo Ledesma-Amaro

维护者:Lara Selles Vidal < Lara。销售在oist.jp>，拉斐尔阿亚拉<拉斐尔。阿亚拉在oist.jp>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("rfaRm")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“rfaRm”)

超文本标记语言	R脚本	rfaRm
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，FunctionalGenomics，MultipleSequenceAlignment，软件，ThirdPartyClient，可视化
版本	3
在Bioconductor	BioC 3.11 (R-4.0)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	httr，stringi，rsvg，魔法，data.table，Biostrings跑龙套,房车，xml2，IRanges，S4Vectors
链接
建议	R4RNA，treeio，knitr，BiocStyle，rmarkdown，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	rfaRm_1.4.3.tar.gz
Windows二进制	rfaRm_1.4.3.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	rfaRm_1.4.3.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rfaRm
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rfaRm
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rfaRm/
软件包下载报告	下载数据