regsplice

DOI:10.18129 / B9.bioc.regsplice

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅regsplice

L1-regularization基于微分检测拼接的方法

Bioconductor版本:3.13

统计方法检测微分拼接(微分外显子用法)RNA-seq和外显子微阵列数据,使用L1-regularization(套索)来提高能力。

作者:卢卡斯·m·韦伯(aut (cre)

维护人员:卢卡斯·m·韦伯在gmail.com < lukas.weber.edu >

从内部引用(R,回车引用(“regsplice”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“regsplice”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“regsplice”)

HTML R脚本 regsplice工作流
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews AlternativeSplicing,DifferentialExpression,DifferentialSplicing,ExonArray,ExperimentalDesign,ImmunoOncology,微阵列,RNASeq,测序,软件
版本 1.18.0
Bioconductor自 BioC 3.4 (r - 3.3)(5年)
许可证 麻省理工学院+文件许可证
取决于
进口 glmnet,SummarizedExperiment,S4Vectors,limma,刨边机统计数据,pbapply、跑龙套、方法
链接
建议 testthat,BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/lmweber/regsplice
BugReports https://github.com/lmweber/regsplice/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 regsplice_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 regsplice_1.18.0.zip
macOS 10.13(高山脉) regsplice_1.18.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/regsplice
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ regsplice
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/regsplice/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
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