rWikiPathways

DOI:10.18129 / B9.bioc.rWikiPathways

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见rWikiPathways

rWikiPathways -用于WikiPathways API的R客户端库

Bioconductor版本:3.13

使用此包与WikiPathways API进行交互。它提供了对多种数据和图像格式的WikiPathways内容的编程访问,包括官方每月发布的文件和方便的GMT读写功能。

作者:埃贡·威利哈根[aut, cre],亚历克斯·皮科[au]

维护者:Egon Willighagen < Egon。Willighagen在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“rWikiPathways”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("rWikiPathways")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“rWikiPathways”)

超文本标记语言 R脚本 1.概述
超文本标记语言 R脚本 2.rWikiPathways和BridgeDbR
超文本标记语言 R脚本 3.rWikiPathways和RCy3
超文本标记语言 R脚本 4.路径分析
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews GraphAndNetwork代谢组学网络软件ThirdPartyClient可视化
版本 1.12.0
在Bioconductor BioC 3.7 (R-3.5)(3.5年)
许可证 MIT +文件许可证
取决于
进口 httr跑龙套,XMLrjsondata.tabletidyrRCurl
链接
建议 testthatBiocStyleknitrrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/wikipathways/rwikipathways
BugReports https://github.com/wikipathways/rwikipathways/issues
全靠我
进口我 famatmultiSightNoRCETimiRGeN
建议我 TRONCO
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 rWikiPathways_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 rWikiPathways_1.12.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) rWikiPathways_1.12.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rWikiPathways
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rWikiPathways
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/rWikiPathways/
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文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网