rWikiPathways

DOI:10.18129 / B9.bioc.rWikiPathways

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见rWikiPathways．

rWikiPathways -用于WikiPathways API的R客户端库

Bioconductor版本:3.13

使用此包与WikiPathways API进行交互。它提供了对多种数据和图像格式的WikiPathways内容的编程访问，包括官方每月发布的文件和方便的GMT读写功能。

作者:埃贡·威利哈根[aut, cre]，亚历克斯·皮科[au]

维护者:Egon Willighagen < Egon。Willighagen在gmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("rWikiPathways")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“rWikiPathways”)

超文本标记语言	R脚本	1.概述
超文本标记语言	R脚本	2.rWikiPathways和BridgeDbR
超文本标记语言	R脚本	3.rWikiPathways和RCy3
超文本标记语言	R脚本	4.路径分析
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	GraphAndNetwork，代谢组学，网络，软件，ThirdPartyClient，可视化
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 3.7 (R-3.5)(3.5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于
进口	httr跑龙套,XML，rjson，data.table，tidyr，RCurl
链接
建议	testthat，BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/wikipathways/rwikipathways
BugReports	https://github.com/wikipathways/rwikipathways/issues
全靠我
进口我	famat，multiSight，NoRCE，TimiRGeN
建议我	TRONCO
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	rWikiPathways_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	rWikiPathways_1.12.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	rWikiPathways_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rWikiPathways
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rWikiPathways
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rWikiPathways/
软件包下载报告	下载数据