plyranges

DOI:10.18129 / B9.bioc.plyranges

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见plyranges

一个流畅的界面操作基因组范围

Bioconductor版本:3.13

一个类似dplyr的界面,用于与常见的Bioconductor类Ranges和GenomicRanges交互。通过提供一种语法和一致的方式来操作这些类,希望能够增加新Bioconductor用户的可访问性。

作者:Stuart Lee [aut, cre]、迈克尔·劳伦斯[aut, ctb]、黛安·库克[aut, ctb]、斯宾塞·奈斯特罗姆[ctb]

维护者:Stuart Lee < Stuart .andrew。李在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“plyranges”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("plyranges")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“plyranges”)

超文本标记语言 R脚本 简介
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文本 新闻

细节

biocViews 报道DataRepresentation基础设施软件WorkflowStep
版本 1.12.1
在Bioconductor BioC 3.7 (R-3.5)(3.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.5),BiocGenericsIRanges(> = 2.12.0),GenomicRanges(> = 1.28.4)
进口 方法,dplyrrlang(> = 0.2.0),magrittrtidyselect(> = 1.0.0),rtracklayerGenomicAlignmentsGenomeInfoDbRsamtoolsS4Vectors(>= 0.23.10), utils
链接
建议 knitrBiocStylermarkdowntestthat(> =魅惑,HelloRangesHelloRangesDataBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19pasillaBamSubsetcovrggplot2
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/sa-lee/plyranges
全靠我
进口我 BUSpaRsedasperfluentGenomicsInPASmethylCCmulticrisprnearBynding
建议我 模因
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 plyranges_1.12.1.tar.gz
Windows二进制 plyranges_1.12.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra) plyranges_1.12.1.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/plyranges
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/plyranges
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/plyranges/
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