perturbatr

DOI:10.18129 / B9.bioc.perturbatr

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见perturbatr．

高通量遗传扰动筛选的统计分析

Bioconductor版本:3.13

Perturbatr对由多个筛选组成的集成数据集进行大规模遗传扰动筛选的分阶段分析。对于多重综合扰动屏，拟合了考虑不同生物条件间方差的层次模型。然后使用网络传播算法进一步扩展所得到的基因效应列表，以纠正假阴性。

作者:Simon Dirmeier [aut, cre]

维护者:Simon Dirmeier < Simon。Dirmeier在web.de>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

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browseVignettes(“perturbatr”)

超文本标记语言	R脚本	perturbatr食谱
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文本		新闻

细节

biocViews	CellBasedAssays，ImmunoOncology，网络，回归，软件
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 3.7 (R-3.5)(3.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R(>= 3.5)，方法，统计
进口	dplyr，ggplot2，tidyr，为了，lme4样条函数,igraph，foreach平行,doParallel，diffusr，lazyeval，宠物猫，网格，utils，图形，尺度，magrittr，formula.tools，rlang
链接
建议	testthat，lintr，knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/cbg-ethz/perturbatr
BugReports	https://github.com/cbg-ethz/perturbatr/issues
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	perturbatr_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	perturbatr_1.12.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	perturbatr_1.12.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/perturbatr
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/perturbatr
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/perturbatr/
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