panelcn.mops

DOI:10.18129 / B9.bioc.panelcn.mops

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅panelcn.mops。

CNV检测目标门店面板数据的工具

Bioconductor版本:3.13

CNV检测目标门店面板数据的工具。cn的延伸。拖把包。

作者:Verena Haunschmid Gundula Povysil

维护人员:Gundula Povysil < Povysil在bioinf.jku.at >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“panelcn.mops”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“panelcn.mops”)

PDF	R脚本	panelcn.mops: Manual for the R package
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBiology,CopyNumberVariation,遗传学,GenomicVariation,测序,软件,VariantDetection
版本	1.14.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(4年)
许可证	LGPL (> = 2.0)
取决于	R (> = 3.4),cn.mops、方法、跑龙套、统计数据、图形
进口	GenomicRanges,Rsamtools,IRanges,S4Vectors,GenomeInfoDb,grDevices
链接
建议	knitr,rmarkdown,RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	CopyNumberPlots
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	panelcn.mops_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	panelcn.mops_1.14.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	panelcn.mops_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/panelcn.mops
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ panelcn.mops
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/panelcn.mops/
包下载报告	下载数据