此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见oppti.
Bioconductor版本:3.13
oppti的目的是分析蛋白质(和磷酸盐)的表达,以找到给定队列中每个样本的外围标记,以发现个性化的可操作目标。
作者:Abdulkadir Elmas
维护者:Abdulkadir Elmas < Abdulkadir。在mssm。edu>
引文(从R内,输入引用(“oppti”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("oppti")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“oppti”)
超文本标记语言 | R脚本 | 离群蛋白和磷酸靶标识符 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | BiomedicalInformatics,DifferentialExpression,GeneExpression,GeneTarget,网络,蛋白质组学,回归,软件 |
版本 | 1.6.0 |
在Bioconductor | BioC 3.10 (R-3.6)(2年) |
许可证 | 麻省理工学院 |
取决于 | R (>= 3.6) |
进口 | limma统计数据,重塑,ggplot2grDevices,RColorBrewer,pheatmap,knitr、方法、devtools |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/Huang-lab/oppti |
BugReports | https://github.com/Huang-lab/oppti/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | oppti_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | oppti_1.6.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | oppti_1.6.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/oppti |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/oppti |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/oppti/ |
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