openCyto

DOI:10.18129 / B9.bioc.openCyto

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅openCyto。

流式细胞仪数据分层浇注管道

Bioconductor版本:3.13

这个包是为了便于自动化控制方法以连续的方式来模拟手动控制策略。

作者:迈克江,约翰Ramey,格雷格•Finak拉斐尔Gottardo

维修工:迈克江泽民< wjiang2 fhcrc.org >,杰克瓦格纳< jpwagner fhcrc.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“openCyto”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“openCyto”)

HTML	R脚本	介绍openCyto包
HTML	R脚本	如何使用不同的自动控制功能
HTML	R脚本	如何编写一个csv浇注模板吗
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,DataRepresentation,FlowCytometry,ImmunoOncology,预处理,软件
版本	测试盒框
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(8年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	方法,Biobase,BiocGenerics,gtools,flowCore(> = 1.99.17),flowViz,ncdfFlow(> = 2.11.34),flowWorkspace(> = 3.99.1),flowStats(> = 3.99.1),flowClust(> = 3.11.4),质量,线索,plyr,RBGL,图,data.table,ks,RColorBrewer,晶格,rrcov,R.utils
链接	Rcpp
建议	flowWorkspaceData,knitr,testthat,跑龙套,工具,平行,ggcyto,CytoML
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	CytoML
建议我	催化剂,flowClust,flowCore,flowStats,flowTime,flowWorkspace,ggcyto
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	openCyto_2.4.0.tar.gz
Windows二进制	openCyto_2.4.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	openCyto_2.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/openCyto
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ openCyto
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/openCyto/
包下载报告	下载数据