ontoProc

DOI:10.18129 / B9.bioc.ontoProc

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见ontoProc．

解剖、细胞系等本体的处理

Bioconductor版本:3.13

支持收集各种生物信息本体，特别利用CRAN上的ontologyIndex包。我们提供了关于细胞、细胞系、化合物和解剖学术语的关键本体快照，以帮助分析基因组规模的实验，特别是细胞x化合物筛选。另一个目的是加强引人注目的用例的开发，以实现新兴本体的更丰富的接口。

作者:Vince Carey

维护者:VJ Carey

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("ontoProc")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ontoProc”)

超文本标记语言	R脚本	ontoProc:一些面向本体的实用程序，为Bioconductor提供单细胞功能
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	去，基础设施，软件
版本	1.14.0
在Bioconductor	BioC 3.6 (R-3.4)(4年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.5)，ontologyIndex
进口	Biobase，S4Vectors、方法、AnnotationDbi，统计，utils，BiocFileCache，闪亮的，图，Rgraphviz，ontologyPlot，dplyr，magrittr，DT，igraph
链接
建议	knitr，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，testthat，BiocStyle，SingleCellExperiment，celldex，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	pogo，tenXplore
建议我	BiocOncoTK
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ontoProc_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	ontoProc_1.14.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	ontoProc_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ontoProc
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ontoProc
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ontoProc/
软件包下载报告	下载数据