ncRNAtools

DOI:10.18129 / B9.bioc.ncRNAtools

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ncRNAtools。

非编码RNA的R工具包

Bioconductor版本:3.13

ncRNAtools提供了一组基本的工具来处理和分析非编码rna。这些包括工具访问RNAcentral数据库和预测和可视化的非编码rna二级结构。包还提供了工具来读、写和互换等代表的文件格式最常用的二级结构。

作者:劳拉出售维达尔(cre, aut)拉斐尔•阿亚拉(aut),Guy-Bart斯坦(aut),罗德里戈Ledesma-Amaro (aut)

维修工:劳拉出售比达尔<劳拉。销售在oist.jp >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ncRNAtools”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ncRNAtools”)

HTML	R脚本	rfaRm
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,FunctionalGenomics,软件,StructuralPrediction,ThirdPartyClient,可视化
版本	1.2.1 "
Bioconductor自	BioC 3.12 (r - 4.0)(1年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	httr,xml2跑龙套,方法、grDevicesggplot2,IRanges,GenomicRanges,S4Vectors
链接
建议	knitr,BiocStyle,rmarkdown,RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/LaraSellesVidal/ncRNAtools/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ncRNAtools_1.2.1.tar.gz
Windows二进制	ncRNAtools_1.2.1.zip
macOS 10.13(高山脉)	ncRNAtools_1.2.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ncRNAtools
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ncRNAtools
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ncRNAtools/
包下载报告	下载数据