multiSight

DOI:10.18129 / B9.bioc.multiSight

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅multiSight。

Multi-omics分类、功能性浓缩和网络推理分析

Bioconductor版本:3.13

multiSight R包提供一个用户友好的图形界面来分析您的数据使multi-omics方式基于她的假定值池和多个块的统计方法。为每个数据集提供,使multiSight提供分类模型与特征选择可以使用生命指标:(i)预测表型(如诊断任务,组织学亚型),(2)设计途径和基因本体充实(分析)表示,(iii)构建网络推理与PubMed查询简化假设和数据驱动的。

作者:Florian Jeanneret (cre, aut)Stephane Gazut (aut)

维护人员:Florian Jeanneret <弗洛里安。在cea.fr jeanneret >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“multiSight”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“multiSight”)

HTML	R脚本	multiSight快速入门指南
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	分类,DifferentialExpression,GeneSetEnrichment,网络,NetworkInference,通路,RNASeq,软件,microrna的
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(< 6个月)
许可证	CeCILL +文件许可证
取决于	R (> = 4.1)
进口	傀儡,配置,R6,闪亮的,shinydashboard,DT,dplyr,stringr,anyLib,脱字符号,biosigner,mixOmics统计数据,DESeq2,clusterProfiler,rWikiPathways,ReactomePA,enrichplot,ppcor,metap,infotheo,igraph,networkD3,easyPubMed跑龙套,htmltools,rmarkdown
链接
建议	org.Mm.eg.db,rlang,减价,尝试,processx,testthat,knitr,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/Fjeanneret/multiSight/issues
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	multiSight_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	multiSight_1.0.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	multiSight_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/multiSight
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ multiSight
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/multiSight/
包下载报告	下载数据