微生物组

DOI:10.18129 / B9.bioc.microbiome

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅微生物组

微生物分析

Bioconductor版本:3.13

公用事业进行微生物分析。

作者:狮子座拉赫蒂(aut (cre),苏达山谢蒂(aut)

维护人员:狮子座拉赫蒂<狮子座。拉赫蒂在iki.fi >

从内部引用(R,回车引用(微生物)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(微生物)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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HTML R脚本 微生物R包
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews 宏基因组,微生物组,测序,软件,SystemsBiology
版本 1.14.0
Bioconductor自 BioC 3.6 (r - 3.4)(4年)
许可证 BSD_2_clause +文件许可证
取决于 R (> = 3.6.0),phyloseq,ggplot2
进口 dplyr,reshape2,Rtsne,尺度统计数据,宠物猫,tidyr跑龙套,素食主义者
链接
建议 BiocGenerics,BiocStyle,开罗,knitr,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL http://microbiome.github.io/microbiome
BugReports https://github.com/microbiome/microbiome/issues
取决于我
进口我 ANCOMBC
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 microbiome_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 microbiome_1.14.0.zip
macOS 10.13(高山脉) microbiome_1.14.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/microbiome
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/微生物
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/microbiome/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网