miRspongeR

DOI:10.18129 / B9.bioc.miRspongeR

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅miRspongeR

识别和分析microrna的海绵和模块交互网络

Bioconductor版本:3.13

这个包提供了一些函数来研究microrna的海绵(也称为龙头或microrna的诱饵),包括流行的方法识别microrna的海绵交互,和综合的方法来集成microrna的海绵交互从不同的方法,以及功能验证microrna的海绵交互,并推断microrna的海绵模块,进行浓缩分析模块,对模块进行生存分析。

作者:Junpeng张

维护人员:张Junpeng < zhangjunpeng_411 yahoo.com >

从内部引用(R,回车引用(“miRspongeR”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“miRspongeR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“miRspongeR”)

HTML R脚本 miRspongeR:识别和分析的microrna的海绵和模块交互网络
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews BiomedicalInformatics,GeneExpression,微阵列,NetworkEnrichment,软件,生存
版本 1.18.0
Bioconductor自 BioC 3.9 (r - 3.6)(2.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 3.5.0)
进口 corpcor平行,igraph,制程,clusterProfiler,ReactomePA,剂量,生存grDevices,图形,统计数据,varhandle,linkcomm跑龙套,Rcpp,org.Hs.eg.db
链接
建议 BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/zhangjunpeng411/miRspongeR/issues
取决于我
进口我 miRSM
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 miRspongeR_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 miRspongeR_1.18.0.zip
macOS 10.13(高山脉) miRspongeR_1.18.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRspongeR
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ miRspongeR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/miRspongeR/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网