methylInheritance

DOI:10.18129 / B9.bioc.methylInheritance

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见methylInheritance．

基于置换的分析将多代保守差异甲基化元素与治疗效果联系起来

Bioconductor版本:3.13

基于蒙特卡罗抽样的排列分析，用于检验以下假设:几代之间保守的差异甲基化元素的数量与从处理中继承的效应有关，并且可以忽略随机效应。

作者:Astrid Deschênes [cre, aut]，帕斯卡·贝洛[au]，阿诺·德罗伊特[au]

维护者:Astrid Deschênes

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" methyllinheritance ")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“methylInheritance”)

超文本标记语言	R脚本	基于置换的分析将多代保守差异甲基化元素与治疗效果联系起来
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细节

biocViews	BiologicalQuestion，DNAMethylation，DifferentialMethylation，表观遗传学，ImmunoOncology，MethylSeq，测序，软件，StatisticalMethod，WholeGenome
版本	1.16.0
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(4.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.5)
进口	methylKit，BiocParallel，GenomicRanges，IRanges，S4Vectors，方法，并行，ggplot2，gridExtra，字谜
链接
建议	BiocStyle，BiocGenerics，knitr，rmarkdown，RUnit，methInheritSim
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/adeschen/methylInheritance
BugReports	https://github.com/adeschen/methylInheritance/issues
全靠我
进口我
建议我	methInheritSim
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	methylInheritance_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	methylInheritance_1.16.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	methylInheritance_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methylInheritance
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/methylInheritance
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/methylInheritance/
软件包下载报告	下载数据