methylCC

DOI:10.18129 / B9.bioc.methylCC

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅methylCC

估计全血在DNA甲基化的细胞组成样本

Bioconductor版本:3.13

一个工具来估计DNA甲基化的细胞组成全血样品测量技术(芯片和测序)在任何平台。

作者:斯蒂芬妮·c·希克斯(aut (cre)拉斐尔•伊(aut)

维护人员:斯蒂芬妮·c·希克斯< shicks19 jhu.edu >

从内部引用(R,回车引用(“methylCC”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“methylCC”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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HTML R脚本 methylCC用户指南
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文本 新闻

细节

biocViews DNAMethylation,MethylSeq,MethylationArray,微阵列,测序,软件,WholeGenome
版本 1.6.0
Bioconductor自 BioC 3.10 (r - 3.6)(2年)
许可证 CC 4.0
取决于 R (> = 3.6),FlowSorted.Blood.450k
进口 Biobase,GenomicRanges,IRanges,S4Vectors,dplyr,magrittr,minfi,bsseq,quadprog,plyranges,统计,跑龙套,bumphunter,genefilter、方法、IlluminaHumanMethylation450kmanifest,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19
链接
建议 knitr,testthat(> =魅惑,BiocGenerics,BiocStyle,tidyr,ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/stephaniehicks/methylCC/
BugReports https://github.com/stephaniehicks/methylCC/
取决于我
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包档案

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源包 methylCC_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 methylCC_1.6.0.zip
macOS 10.13(高山脉) methylCC_1.6.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methylCC
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ methylCC
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/methylCC/
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