这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅loci2path。
Bioconductor版本:3.13
loci2path执行statistics-rigorous浓缩eQTLs基因组分析感兴趣的区域。使用eQTL Genotype-Tissue表达式(GTEx)项目提供的集合,从MSigDB路径集合。
作者:Tianlei徐
维护人员:徐Tianlei < Tianlei。徐:emory.edu >
从内部引用(R,回车引用(“loci2path”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“loci2path”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“loci2path”)
HTML | R脚本 | loci2path |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | BioCarta,报道,FunctionalGenomics,GeneExpression,GeneSetEnrichment,遗传学,测序,软件 |
版本 | 1.12.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.7 (r - 3.5)(3.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 3.4) |
进口 | pheatmap,wordcloud,RColorBrewer,data.table、方法、grDevices统计数据、图形、GenomicRanges,BiocParallel,S4Vectors |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/StanleyXu/loci2path |
BugReports | https://github.com/StanleyXu/loci2path/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | loci2path_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | loci2path_1.12.0.zip |
macOS 10.13(高山脉) | loci2path_1.12.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/loci2path |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ loci2path |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/loci2path/ |
包下载报告 | 下载数据 |