莱斯
DOI:10.18129 / B9.bioc.les
此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见莱斯．
识别平铺微阵列数据中的差异效应
Bioconductor版本:3.13
“les”包估计平铺微阵列数据中的增强显著性位点(les)。这些是调控区域，如在差异转录、CHiP-chip或DNA修饰分析中发现的。该软件包提供了一个通用框架，适用于识别平铺微阵列数据集中的差异效应，并且独立于单个探针级别的底层统计数据。
作者:Julian Gehring, Clemens Kreutz, Jens Timmer
维护者:Julian Gehring
引文(从R内，输入引用(les))：
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("les")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes (les)
| R脚本 | les包介绍:用增强显著性框架的位点识别平铺微阵列数据中的差异效应 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | ChIPchip，DNAMethylation，DifferentialExpression，微阵列，软件，转录 |
| 版本 | 1.42.0 |
| 在Bioconductor | BioC 2.7 (R-2.12)(11年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R(>= 2.13.2)，方法，图形，fdrtool |
| 进口 | 引导，gplots，RColorBrewer |
| 链接 | |
| 建议 | Biobase，limma |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | 平行 |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | GSRI |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | les_1.42.0.tar.gz |
| Windows二进制 | les_1.42.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | les_1.42.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/les |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/les |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/les/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
