这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅iasva。
Bioconductor版本:3.13
迭代调整代理变量分析(IA-SVA)是一个统计框架发现隐藏的变异来源,即使这些来源是相关的。IA-SVA提供了一个灵活的方法我)确定一个不必要的异质性的隐藏因素而调整了所有已知的因素;ii)测试的意义的假定的隐藏因素解释了未建模的变化数据;和iii),如果重要,使用估计因子作为下一次迭代的其他已知因素进一步揭示隐藏的因素。
作者:Donghyung李(aut (cre),安东尼程(aut),内森软件(aut) Duygu Ucar (aut)
维护人员:李Donghyung < Donghyung。李在jax.org >,安东尼程<安东尼。程在jax.org >
从内部引用(R,回车引用(“iasva”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“iasva”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“iasva”)
HTML | R脚本 | 检测单细胞RNA-Seq数据中隐藏的异质性 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | BatchEffect,FeatureExtraction,ImmunoOncology,预处理,质量控制,RNASeq,软件,StatisticalMethod |
版本 | 1.10.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.8 (r - 3.5)(3年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (> = 3.5) |
进口 | irlba统计数据,集群、图形、SummarizedExperiment,BiocParallel |
链接 | |
建议 | knitr,testthat,rmarkdown,股东价值分析,Rtsne,pheatmap,corrplot,DescTools,RColorBrewer |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | iasva_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | iasva_1.10.0.zip |
macOS 10.13(高山脉) | iasva_1.10.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/iasva |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ iasva |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/iasva/ |
包下载报告 | 下载数据 |