iChip

DOI:10.18129 / B9.bioc.iChip

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见iChip．

基于隐Ising模型的芯片数据贝叶斯建模

Bioconductor版本:3.13

隐Ising模型用于识别ChIP-chip数据中的富集基因组区域。它们可用于分析来自多个平台的数据(例如，Affymetrix, Agilent和NimbleGen)，以及具有单个或多个重复的数据。

作者:莫千行

维护者:千星莫<千星。莫在moffitt.org>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("iChip")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“iChip”)

PDF	R脚本	iChip
PDF		参考手册

细节

biocViews	AgilentChip，ChIPchip，微阵列，OneChannel，软件
版本	1.46.0
在Bioconductor	BioC 2.6 (R-2.11)(11.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 2.10.0)
进口	limma
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	iChip_1.46.0.tar.gz
Windows二进制	iChip_1.46.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	iChip_1.46.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/iChip
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/iChip
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/iChip/
软件包下载报告	下载数据