这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅hiReadsProcessor。
Bioconductor版本:3.13
hiReadsProcessor包含的函数允许用户进程LM-PCR产品排序使用任何平台。给定一个excel /多路分解txt文件包含参数和样本的元数据,自动调整功能基因组的适配器和识别产品。基因产品进一步加工的质量控制和丰富量化。
作者:Nirav V Malani < malnirav gmail.com >
维护人员:Nirav V Malani < malnirav gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“hiReadsProcessor”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“hiReadsProcessor”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“hiReadsProcessor”)
HTML | R脚本 | 使用hiReadsProcessor |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 预处理,测序,软件 |
版本 | 1.28.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.0 (r - 3.1)(7年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | Biostrings,GenomicAlignments,BiocParallel,hiAnnotatorR (> = 3.0) |
进口 | sonicLength,dplyr,BiocGenerics,GenomicRanges,readxl、方法 |
链接 | |
建议 | knitr,testthat |
SystemRequirements | 咩咩咩咩的叫声,UCSC hg18 2位格式 |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | hiReadsProcessor_1.28.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13(高山脉) | hiReadsProcessor_1.28.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hiReadsProcessor |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ hiReadsProcessor |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/hiReadsProcessor/ |
包下载报告 | 下载数据 |