gwascat

DOI:10.18129 / B9.bioc.gwascat

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅gwascat

EMBL-EBI GWAS的表示和建模数据目录

Bioconductor版本:3.13

表示和模型数据在EMBL-EBI GWAS目录。

作者:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >

维修工:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >

从内部引用(R,回车引用(“gwascat”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“gwascat”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“gwascat”)

HTML R脚本 gwascat——农庄GWAS在EBI目录
HTML R脚本 gwascat:结构和查询NHGRI GWAS目录
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 遗传学,软件
版本 2.24.0
Bioconductor自 BioC 2.10 (r - 2.15)(9.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(> = 3.5.0)方法
进口 S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges(> = 1.29.6),GenomicFeatures,readr,Biostrings,AnnotationDbi,BiocFileCache,snpStats,VariantAnnotation,AnnotationHub
链接
建议 DO.db,DT,knitr,RBGL,testthat,rmarkdown,Gviz,Rsamtools,IRanges,rtracklayer,,ggbio,DelayedArray,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,org.Hs.eg.db,BiocStyle
SystemRequirements
增强了 SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37
URL
取决于我 liftOver,vtpnet
进口我 circRNAprofiler
建议我 GenomicScores,grasp2db,hmdbQuery,ldblock,parglms,TFutils
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 gwascat_2.24.0.tar.gz
Windows二进制 gwascat_2.24.0.zip
macOS 10.13(高山脉) gwascat_2.24.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gwascat
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ gwascat
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/gwascat/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网