石墨
DOI:10.18129 / B9.bioc.graphite
此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见石墨．
路径拓扑环境的相互作用
Bioconductor版本:3.13
来自KEGG、Panther、PathBank、pharmkb、Reactome SMPDB和WikiPathways数据库的路径拓扑的图对象。
作者:Gabriele Sales < Gabriele。在unipd.it>销售，Enrica Calura
维护者:Gabriele Sales < Gabriele。在unipd.it>销售
引文(从R内，输入引用(石墨))：
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("graphite")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(石墨)
| R脚本 | 路径拓扑环境的相互作用 | |
| metabolites.pdf | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | GraphAndNetwork，KEGG，代谢组学，网络，通路，Reactome，软件，ThirdPartyClient |
| 版本 | 1.38.0 |
| 在Bioconductor | BioC 2.9 (R-2.14)(10年) |
| 许可证 | AGPL-3 |
| 取决于 | R(>= 2.10)，方法 |
| 进口 | AnnotationDbi，使彻底失败，图(> = 1.67.1),httr，rappdirs，统计，效用 |
| 链接 | |
| 建议 | a4Preproc，所有，BiocStyle，限幅器，codetools，hgu133plus2.db，hgu95av2.db，嫁祸于，knitr，org.Hs.eg.db平行,R.rsp，RCy3，rmarkdown，SPIA(> = 2.2),testthat，topologyGSA(> = 1.4.0) |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | PoTRA，ToPASeq |
| 进口我 | dce，EnrichmentBrowser，mogsa，multiGSEA，ReactomePA，StarBioTrek |
| 建议我 | 限幅器，InterCellar，metaboliteIDmapping |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | graphite_1.38.0.tar.gz |
| Windows二进制 | graphite_1.38.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | graphite_1.38.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/graphite |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/graphite |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/graphite/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
