genefu

DOI:10.18129 / B9.bioc.genefu

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见genefu．

乳腺癌基因表达特征的计算

Bioconductor版本:3.13

该软件包包含执行基因表达分析通常需要的各种任务的功能，特别是在乳腺癌研究中:不同微阵列平台之间的基因定位，分子亚型的识别，已发表基因签名的实现，基因选择和生存分析。

作者:Deena m.a Gendoo [aut]， Natchar Ratanasirigulchai [aut]， Markus S. Schroeder [aut]， Laia Pare [aut]， Joel S Parker [aut]， Aleix Prat [aut]， Nikta Feizi [ctb]， Christopher Eeles [ctb]， Benjamin Haibe-Kains [aut, cre]

维护者:Benjamin Haibe-Kains < Benjamin .haibe。Kains at utoronto.ca>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("genefu")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“genefu”)

超文本标记语言	R脚本	genefu:乳腺癌基因表达分析包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	分类，聚类，DifferentialExpression，GeneExpression，软件，可视化
版本	2.24.2
在Bioconductor	BioC 2.8 (R-2.13)(10.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.1)，survcomp，biomaRt，iC10，目标
进口	北极监测和评估方案，嫁祸于，mclust，limma，图形，统计，效用
链接
建议	GeneMeta，breastCancerVDX，breastCancerMAINZ，breastCancerTRANSBIG，breastCancerUPP，breastCancerUNT，breastCancerNKI，rmeta，Biobase，xtable，knitr，脱字符号，生存，BiocStyle，魔法，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.pmgenomics.ca/bhklab/software/genefu
全靠我
进口我	consensusOV，PDATK
建议我	breastCancerMAINZ，breastCancerNKI，breastCancerTRANSBIG，breastCancerUNT，breastCancerUPP，breastCancerVDX，GSgalgoR
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	genefu_2.24.2.tar.gz
Windows二进制	genefu_2.24.2.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	genefu_2.24.2.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genefu
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/genefu
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/genefu/
软件包下载报告	下载数据